История таможни на Слобожанщине насчитывает порядка 350 лет - в 1660 году харьковский воевода Иван Офросимов получил царскую грамоту, которой повеливалось построить в Харькове таможенную «избу» и для таможенной службы выбрать так называемых «целовальников» (таможенников) из служивых людей. В 1665 году харьковчане впервые были обложены оброком. В следующем году из них стали брать сбор за переезд по мосту через реку Харьков.

В 1870 была основана Харьковская главная складская таможня - одна из десяти внутренних таможен России. Задача Харьковской таможни заключалась в сборе пошлины с иностранных товаров и почтовых посылок непосредственно в городе Харькове. После Февральской революции 1917 г. Харьковская таможня оставалась в ведении Департамента таможенных сборов Министерства финансов Временного правительства. С апреля 1918 таможня переходит в ведение Департамента таможенных сборов Министерства финансов Украинской Народной Республики. В начале 1919 г. Харьковская таможня была единственным таможенным органом в Украине, который осуществлял контроль за контрабандными делами.

Новейший период истории Харьковской таможни начинается с обретения Украиной независимости – тогда и была установлена таможенная граница со всеми соседними государствами. Харьковская таможня неоднократно преобразовывалась – совсем недавно появилась Харьковская областная таможня, штат которой насчитывает 1 114 сотрудников.

Ежедневно в зоне деятельности Харьковской областной таможни пересекает границу около 20 000 граждан. А во время праздников и в сезон отпусков их число возрастает в несколько раз.